神社的中心是本殿和拜殿。本殿不對外開放,但遊客可以在拜殿前祈願。拜殿寬大的弧形銅瓦屋頂帶著一抹銅綠色,與建築的朱紅色木造結構形成鮮明對比。山牆則飾有雕刻和金屬裝飾,入口上方懸掛著一條「注連繩」(用來標明聖地的特殊繩索)。到了春季,神社境內將開滿淡粉色的櫻花。
除了主要神社的建築外,神社內還設有一個展廳,按時間順序展示從明治維新到第二次世界大戰的日本歷史。展品包括歷史事件和年輕士兵們的黑白老照片,以及當時世界最大的戰艦「大和號」1:100比例的模型等相關紀念品。進入展廳需支付一小筆入場費。
雖然護國神社以其歷史背景著稱,但很多人來此是為了慶祝「初宮詣」(新生兒的祝福儀式)和舉辦傳統婚禮。不僅如此,遊客們也會來此祈求平安,而且也可以在神社購買「御守」(護身符)。